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free and open access to biodiversity data

RB - Rio de Janeiro Botanical Garden Herbarium Collection

Versão mais recente publicado por Instituto de Pesquisas Jardim Botanico do Rio de Janeiro em Oct 2, 2018 Instituto de Pesquisas Jardim Botanico do Rio de Janeiro

Created over a century ago, the RB currently comprises ca. 750,000 mounted specimens, with a strong representation of Brazilian flora, mainly from the Atlantic and Amazon forests. Nearly 100% of these specimens have been entered into the database and imaged and, at present, about 17% have been geo-referenced. This data paper is focused exclusively on RB's exsiccatae collection of land plants and algae, which is currently increasing by about twenty to thirty thousand specimens per year thanks to fieldwork, exchange and donations. Since 2005, many national and international projects have been implemented, improving the quality and accessibility of the collection. The most important facilitating factor in this process was the creation of the institutional system for plants collection and management, named JABOT. Since the RB is continuously growing, the dataset is updated weekly on SiBBr and GBIF portals.

The most represented environments are the Atlantic and Amazon forests, a biodiversity hotspot and the world's largest rain forest, respectively. The dataset described in this article contains the data and metadata of plants and algae specimens in the RB collection and the link to access the respective images. Currently, the RB data is publicly available online at several biodiversity portals, such as our institutional database JABOT, the Reflora Virtual Herbarium, the SiBBr and the GBIF portal. However, a description of the RB dataset as a whole is not available in the literature.

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 720,885 registros. Também existem 2 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

  • Occurrence (core)
    720885
  • Identification 
    816339
  • Multimedia 
    666142

Este IPT armazena os dados e, portanto, serve como um repositório de dados. Os dados e os metadados do recurso estão disponíveis para download no seção de downloads. A tabela de versões lista outras versões do recurso que foram disponibilizadas ao público e permite o rastreamento das alterações realizadas no recurso ao longo do tempo.

Downloads

Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:

Dados como um arquivo DwC-A download 720,885 registros em Portuguese (111 MB) - Frequência de atualização: semanalmente
Metadados como um arquivo EML download em English (12 KB)
Metadados como um arquivo RTF download em English (11 KB)

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

JBRJ - Instituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro. Jabot - Banco de Dados da Flora Brasileira. Disponível em: [http://www.jbrj.gov.br/jabot].

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Instituto de Pesquisas Jardim Botanico do Rio de Janeiro. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 4300f8d5-1ae5-49e5-a101-63894b005868.  Instituto de Pesquisas Jardim Botanico do Rio de Janeiro publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por GBIF Brazil.

Palavras-chave

Specimen; Occurrence

Contatos

Quem criou esse recurso:

Rafaela Forzza
Curator
Rio de Janeiro Botanical Garden Rua Pacheco Leão 915 22460-030 Rio de Janeiro RJ BR 55 21 3204 2082
Eduardo Dalcin
Coordenador do Núcleo de Computação Científica
Jardim Botânico do Rio de Janeiro Rua Pacheco Leão 915 - sala 203 22460-030 Rio de Janeiro RJ BR 55 21 32042116

Quem pode responder a perguntas sobre o recurso:

Rafaela Forzza
Curator
Rio de Janeiro Botanical Garden Rua Pacheco Leão 915 22460-030 Rio de Janeiro RJ BR 55 21 3204 2082

Quem preencher os metadados:

Eduardo Dalcin
Coordenador do Núcleo de Computação Científica
Jardim Botânico do Rio de Janeiro R. Pacheco Leão 915 - sl 203 22460-030 Rio de Janeiro RJ BR 55 21 32042116

Quem mais foi associado com o recurso:

Curador
Rafaela Forzza
Curator
Rio de Janeiro Botanical Garden Rua Pacheco Leão 915 22460-030 Rio de Janeiro RJ BR 55 21 3204 2082

Cobertura Geográfica

The majority of specimens were collected in Brazil (ca. 90%) and the country’s most widely represented region is the Southeast, where the herbarium is based (ca. 349.000 specimens, 50% of the total). The south-eastern states of Rio de Janeiro (ca. 189,000 specimens) and Minas Gerais (ca. 90,000) are represented by the largest number of specimens (Fig. 5). It should be noted that most of this region is part of the Atlantic Forest and Rio de Janeiro state is positioned entirely within this biome. North Brazil ranks second in number of specimens and the states of Amazonas and Pará are the best represented, with ca. 29,000 (ca. 4%) and 28,000 (ca. 4%), respectively (Fig. 5). One of the first great plant collectors in the region, especially with regard to Amazonian flora, was Adolf Ducke, who conducted expeditions in the states of Amazonas and Pará, mainly in the first half of the 20th century.

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-34.162, -74.18], Norte Leste [5.529, -34.453]

Cobertura Taxonômica

Nenhuma descrição disponível

Reino  Plantae,  Fungi

Métodos de Amostragem

The herbarium specimen collection combines specimens from institutional projects, undergraduate and post-graduate research and exchanges or donations from other herbaria. In addition, from 1970 onwards, relevant national projects of flora documentation sent specimens to RB, such as RADAMBRASIL Project (1970-1985) and the Flora Program CNPq (1975-1983, MCT/CNPq 1987). Furthermore, as the official custodian for the Ministry of Environment, RB also receives many specimens from private companies with activities related to environmental impact studies and phytochemical products and most of these specimens are donated in exchange for identification. The institution includes 53 associate researchers and hosts around 550 visiting taxonomists every year, standing out as the most visited herbarium in Brazil. Quality

Área de Estudo Not described
Controle de Qualidade The RB uses the institutional system JABOT to perform all functions regarding herbarium management (i.e. loans, donations, new specimen registration, database management, quality control and web publication). The JABOT is a PostgreSQL database management system with 117 tables specifically created for botanical collections. The data insertion can be made directly into the JABOT interface or via uploading spreadsheets, with controlled and free text fields (Silva et al. 2017).

Descrição dos passos do método:

  1. Plant processing procedures: The herbarium follows the usual procedures for processing specimens (Bridson and Forman 2000, Simpson 2006). Fresh materials are pressed and dried over a stove or in an oven. Once they are dry, specimens are glued on to acid-free paper, with gummed cloth tape or thread for bulky plants. Bryophytes, fungi and lichens are placed into acid-free packets. Algae can also be mounted on acid-free paper with gummed cloth tape or stored in plastic boxes in the case of calcareous algae. Collection

Dados de Coleção

Nome da Coleção Herbário Dimitri Sucre Benjamin
Identificador da Coleção http://sweetgum.nybg.org/ih/herbarium.php?irn=124982
Identificador da Coleção Parental RB
Métodos de preservação do espécime Seco e prensado

Citações bibliográficas

  1. Lanna J, da Silva L, Morim M, Leitman P, Queiroz N, Filardi F, Dalcin E, Oliveira F, Forzza R (2018) Herbarium collection of the Rio de Janeiro Botanical Garden (RB), Brazil. Biodiversity Data Journal 6: e22757. https://doi.org/10.3897/BDJ.6.e22757 https://doi.org/10.3897/BDJ.6.e22757

Metadados Adicionais

Identificadores alternativos 4300f8d5-1ae5-49e5-a101-63894b005868
http://ipt.jbrj.gov.br/jbrj/resource?r=jbrj_rb